参考消息:澳门彩-破解百年难题:AI设计出抗蛇毒血清参考消息:澳门彩-破解百年难题:AI设计出抗蛇毒血清  第1张图片来源:Pixabay

■本报见习记者 杜珊妮 记者 冯丽妃

俗话说,一朝被蛇咬,十年怕井绳。一条蛇究竟能有多毒?

据科学家统计,蛇类造成的特异性死亡率在2%左右。其中一些蛇的致死率更高,如眼镜王蛇致死率高达60%,被咬后30分钟得不到救治就会死亡。

然而,一个多世纪以来,治疗蛇毒的方法几乎没有变化。相关抗体不仅提取成本高昂,而且作用有限。现在,2024年诺贝尔化学奖得主、美国西雅图华盛顿大学医学院教授David Baker与丹麦技术大学的Timothy Patrick Jenkins团队,利用人工智能(AI)技术开发出一种可中和致命眼镜蛇毒素的新型蛋白质,有望破解这一困扰医学界的百年难题。相关研究成果1月15日发表于《自然》。

“由于蛇毒每年会夺去数万人的生命,因此解决这一问题十分迫切。”一位审稿人表示,“这项工作是开创性的,在帮助治疗蛇咬伤患者方面开辟了一个全新的研究领域。”

致命蛇毒

蛇咬伤导致的中毒是一个全球性健康问题,尤其在热带和亚热带地区。据世界卫生组织统计,全球每年有180万至270万人受毒蛇咬伤影响,约10万人丧生、30万人永久性残疾。

全球现存蛇类3000多种,其中约600种有毒。尤其蝰蛇科(如蝮蛇)和眼镜蛇科(如环蛇和眼镜蛇)对人类生命构成的威胁最为严重。

蛇毒含有多种复杂的蛋白质和酶,能够迅速造成组织损伤、出血、神经功能障碍甚至死亡。蛇毒中的三指毒素(3FTxs)是一类高致命的神经毒素,通过与受害者体内的烟碱型乙酰胆碱受体(nAChR澳门免费资料s)结合干扰正常的神经传导,产生一系列病理效应,包括肌肉瘫痪、呼吸衰竭和组织坏死。

一直以来,医学界的治疗手段主要依赖多克隆抗体,后者是从免疫动物,即接种蛇毒抗原的马和羊的血清中提取的。但该方法存在许多问题,如成本高昂、效力有限,以及偏远地区的不可达性。这些抗体还可能产生严重的副作用,如过敏反应和发热,且在对抗某些蛇毒的低免疫原性毒素时效果不佳。

“抗蛇毒血清的安全性和有效性各不相同,必须由训练有素的工作人员在诊所给药,这限制了它们的实用性。”哥斯达黎加大学克洛多米罗·皮卡多研究所的毒素学家Jose Maria Gutierrez说。

对此,中山大学附属第一医院中医内科主治医师张瑜表示,若患者未按医嘱或未经专业人员指导自行使用抗蛇毒血清,可能产生不良反应,如发热、皮疹等。此外,部分人群可能对抗蛇毒血清过敏,因此无法使用。

那么,蛇毒治疗是否存在替代性方法?

游戏改变者

鉴于蛇毒成分的复杂性,Baker与Jenkins团队将重点放在3FTxs上,后者是蛇毒中毒病理生理学的核心问题,难以用动物来源的抗体中和。

研究团队采用深度学习技术,特别是一种名为RFdiffusion的方法设计了全新蛋白质结构。该方法可以让他们从头开始设计蛋白质,而不依赖自然界存在的蛋白质。

基于此,研究团队聚焦设计的蛋白质与3FTxs的β-折叠片之间的相互作用,并利用二级结构和块邻接张量指导RFdiffusion模型,确保设计出的蛋白质与毒素的特定结构域正确配对。通过这种方式,研究团队成功创造出专门针对3FTxs的蛋白质,后者在体外实验中有效中和了3FTx的所有3种亚型。

“这些蛋白质在小鼠身上展现的针对神经毒素的保护效果十分惊人。”Jenkins说。研究结果显示,小鼠存活率为80%至100%,具体取决于剂量、毒素和设计的蛋白质。

不仅如此,研究团队创造的新型蛋白质还具有高稳定性,易于通过微生物发酵策略生产,有望降低成本,提高抗蛇毒疗法的可获得性。“我们的抗蛇毒血清仅利用计算方法就能轻松发现,生产成本低,并且在实验室测试中表现稳定。”Baker说。

这些特点使许多人认为该研究是蛇毒治疗的“游戏改变者”。《自然》审稿人表示,这项研究为解决生物学领域一个非常重要的问题作出了贡献。

药物研发新窗口

2003年,Baker团队成功设计出世界上第一个不存在于自然界的蛋白质Top7。虽然Top7只具有结构而无功能,但这标志着从头设计蛋白质的重大突破。现在,AI从头设计蛋白质成功破解了百年蛇毒治疗难题,也为未来药物研发打开了新窗口。

从头设计蛋白质不依赖于免疫动物,可以使用重组DNA技术制造,从而实现连续稳定的蛋白质供应,且制造成本低,这正是有效解决蛇咬伤的关键。“我们无须进行多轮实验室测试就能找到表现良好的抗蛇毒血清。现在的设计软件非常先进,我们只需测试少量分子即可。”Baker表示。

此外,与大抗体相比,AI设计的高亲和力和特异性结合的蛋白质非常小,能更好地渗透组织,快速中和毒素,避免局部组织损伤或其他致命威胁。

尽管结果令人鼓舞,但研究团队强调,在可预见的未来,传统抗蛇毒血清仍是治疗蛇咬伤的基石。新型抗蛇毒血清可先作为补充剂或强化剂,提升现有疗法的有效性,直到独立的下一代疗法获得批准。

研究团队表示,此次研究中的药物研发方法有助于攻克其他缺乏治疗方案的疾病,如某些病毒感染,并为更多常见疾病研发成本更低的新型药物。

“除了治疗蛇咬伤外,蛋白质设计还有助于简化药物发现过程,特别是在资源有限的环境中。通过降低有效新药的成本、减少资源需求,我们朝着每个人都能得到应有治疗的未来迈出了重要一步。”Baker说。

相关论文信息:

https://doi.org/10.1038/s41586-024-08393-x